在明末清初的时期，中国正处于一个动荡不安的时代。在这个时代里，火药武器（即“热兵器”）的发展经历了一系列的技术瓶颈和困境。这些挑战不仅影响了当时的战争方式，也对后来的军事技术和历史进程产生了深远的影响。以下是关于明朝后期热兵器发展所面临的几个关键问题和挑战：

1. 火器的性能限制：尽管中国在宋代就已经发明了火药，并在明代广泛应用到军事领域，但直到明末，火器的性能仍然受到诸多限制。例如，早期的火炮射程短、精度低，而且装填速度慢，使得它们在实际战斗中的作用有限。此外，由于材料和技术的原因，火炮经常会在发射时发生故障或者炸膛事故，对士兵的生命安全构成威胁。

2. 弹药的供应问题：除了火器本身的问题外，弹药的供应也是一大难题。传统的黑火药虽然威力大，但其易受潮气影响而失去效果的特点使得它在潮湿的环境中很难保持稳定。这导致了在实战中，火枪手或炮手往往因为弹药失效而无法有效打击敌人。同时，由于生产效率低下且成本高昂，大规模生产和储存高质量的黑火药对于当时的国家来说也是一个巨大的负担。

3. 新技术的引进与创新不足：面对上述问题，一些有远见的将领和工匠尝试引入新技术来改进火器性能。例如，戚继光在他的《练兵实纪》中提到过使用铜质子弹以提高射击精度和穿透力；还有关于多管火箭筒等新式武器的设计图纸也被发现。然而，整体上说，这些创新的步伐缓慢且不系统化，未能形成一股推动火器革命的力量。

4. 军队训练和战术适应：即使是最好的火器也需要经过严格训练才能发挥其最大效能。然而，在明末时期，大多数军队的训练水平较低，缺乏有效的战术指导。这就导致了很多情况下，火器并未被充分利用，反而可能成为累赘。此外，由于指挥系统的混乱以及信息传递的不畅，战场上的协同作战也受到了很大影响。

5. 财政压力与政治环境：最后但同样重要的是，明朝后期的政治腐败和经济衰退给火器研发带来了沉重的财政压力。政府投入在军事科技方面的资金严重不足，导致许多项目被迫中断或进展缓慢。同时，频繁的内乱和对外战争的消耗进一步削弱了国家的经济实力，使得火器发展的条件更加恶劣。

综上所述，明朝后期热兵器的发展面临着多重困境，包括技术本身的局限性、后勤保障困难、创新能力不强以及复杂的国内外形势等。这些问题最终制约了中国在这一时期的军事现代化进程，并为随后清朝建立后的军事改革埋下了伏笔。